Le parcours du Marathon est de faible difficulté. Ses principales caractéristiques sont les petites fluctuations d'altitude et la longue route en ligne droite, idéal pour des grandes performances. D'autres caractéristiques sont sa direction Est constante, la longue ligne droite et les zones habitées limitées qu'il traverse et ce, presque jusqu'au 30ème kilomètre. La course commence à partir de Pella, devant la statue d'Alexandre le Grand à cheval, à peine un km du site archéologique du même nom, et quelques 43 mètres au dessus du niveau de la mer. Après le premier km de route en descente, les athlètes arrivent sur l'autoroute Thessalonique-Edesse, 8 km durant, jusqu'à ce qu'ils atteignent Chalkidona. 
Au 8ème km les athlètes entrent dans la ville de Chalkidona.
Au 9ème km ils arrivent à la jonction de Veroia et Thessalonique. Après Chalkidona ils quittent le 10ème km.
Au 13ème km, la route traverse un pont sur le fleuve Axios.
Le 15ème Kilomètre est juste avant le village de Gefyra.
Le 17ème km est la deuxième sortie du village Gefyra.
Le 20ème km est juste après la sortie de Agios Athanasios sur la route nationale.
Le 25ème est un peu après le carrefour de Nea Aghialos.
Le 27ème km est à la hauteur de l'entreprise de fonderie grec ''Sidenor''.
Le 28ème km passage au-dessus de la rivière Gallikos.
Précisément après le 30 km les athlètes passent par Ionia (Diavata) et devant les prémices de la EKO, la Petroleum Company grec (au 32ème km).
La 35e km est au centre de Kordelio, dans la rue Monastiriou.
Au 38ème km les athlètes tournent à droite dans la rue Giannitson.
Au 39ème les coureurs tournent à droite dans la rue Dafnis et puis à gauche dans l'avenue Kountouriotou.
La 40ème km est à la Cour de Thessalonique.
Le 41ème et 42ème km sont dans l'avenue Nikis .
L'arrivée est installée devant la Tour Blanche.